该院泌尿外科成立于1974年，是医院重点学科，泌尿疾病诊疗中心，上饶市泌尿病学重点学科，承担全市泌尿系统的医疗、科研、培训及多所医学院校实习、教学任务。有专科医师9人、护士12人，其中主任医师3名，副主任医师2名，主治医师2名，设病床31张，并成立男科学，下辖体外震波碎石中心及膀胱镜室。主要诊疗疾病：1、泌尿系结石：肾、输尿管、膀胱、尿道结石；2、泌尿系肿瘤：肾良恶性肿瘤、尿路上皮肿瘤、生殖肿瘤；3、前列腺增生：4、泌尿系畸形：尿道下裂、肾盂输尿管交界处狭窄、巨输尿管症、隐睾等：5、泌尿系炎症、损伤等。高新技术项目：1、腹腔镜泌尿外科手术：腹腔镜肾切除术、腹腔镜肾上腺切除术、腹腔镜肾囊肿切除术、腹腔镜输尿管上段取石术等；2、经皮肾镜技术：经皮肾穿刺造瘘术、经皮肾镜碎石取石术等；3、经尿道电切术：尿道疤痕电切术、膀胱肿瘤电切术、前列腺汽化电切术、前列腺悬浮离子切割术等；4、输尿管镜技术：输尿管镜检、输尿管取石、碎石；5、膀胱癌根治术、肠代膀胱术；6、肾上腺嗜铬细胞瘤切除术；7、肾癌根治术，特别是对淋巴结清除有较高的技术。与上海仁济医院保持长期合作关系。主要专科设备：德国w01f前列腺汽化电切仪、输尿管镜、弹道碎石器、腹腔镜：德国悬浮离子切割仪；体外震波碎石器机、膀胱镜等。