神经外科(脑外科）创建于上世纪八十年代中期，现有主任医师1名，副主任医师、副教授3名，硕士研究生6名（包括1名NICU专业医学硕士），科室划分4个亚专业组，分别为脑肿瘤组、脑血管病组、脑外伤组、功能神经外科组。

北京天坛医院神经系统疾病专科联盟成员单位，中国意识障碍医师联盟单位，中国医师协会创伤外科医师分会全国委员单位，江西省整合医学学会神经外科分会常委单位，江西省医学会神经外科分会委员单位，江西省出血性脑卒中专委会常委单位，九江市医学会创伤学分会主委单位。

科室融临床、教学、科研为一体，科室配备有STORZ神经内镜、莱卡手术显微镜、进口颅内压监护仪、术中电生理监护仪、立体定向仪等设备，病区设有重症监护室（NICU），精通各种重症颅脑损伤、自发性脑出血、高血压脑出血、蛛网膜下腔出血的救治，开展了颅骨肿瘤、颅骨缺损、大脑凸面及颅底脑膜瘤、胶质瘤、小脑肿瘤、脑动脉瘤、听神经瘤、垂体瘤、癫痫、三叉神经痛、面肌痉挛、蛛网膜囊肿、先天性脑积水等疾病的显微外科手术治疗以及脑动脉瘤、脑血管畸形介入栓塞治疗。