眼科成立于1949年，独立建制于1982年，现有医师16人，主任医师2人，副主任医师2人，主治医师3人，住院医师8人，研究生5人，验光师2人。其中阜阳市科技拔尖人才1人，阜阳市卫生系统跨世纪学术技术带头人2人。护士13人，其中主管护师4人，护师5人，护士4人。

是阜阳市卫生系统重点专科，先后开展了白内障超声乳化人工晶体植入术，各类斜视矫正术，眼表重建眼科整形术，各类青光眼手术，各类玻璃体视网膜手术、眶内肿瘤摘除术、上睑下垂矫正术，鼻腔泪囊吻合术，飞秒激光准分子治疗屈光不正手术等，并开展了弱视治疗、眼底荧光血管造影、眼底激光术治疗、后囊激光术、泪道激光术治疗，共发表国家级论著、论文40余篇。1999年曾荣获阜阳市科技进步二等奖、四等奖，2008年获阜阳市科技进步一等奖，2010年和2014年获阜阳市科技进步三等奖。其中玻璃体切割手术适用于玻璃体出血、眼内异物、眼内炎、视网膜脱离，晶体脱位、眼外伤等常规手术无法解决的复杂、难治、严重的眼部疾病，玻切手术在我院的成功开展，使我市患者不用再转诊至外地医院接受手术，能够为患者节省转诊所花费的时间与金钱，更加及时、便捷的接受治疗，也使患者术前术后不必经历长途奔波，从而获得更好的休养，这项技术的开展，填补了阜阳市眼科诊疗的一项空白，提高了我院眼科的医疗水平，使我院在皖北地区继续保持领先地位。

目前拥有先进的美国进口白内障冷超声乳化仪，威视s4ir型准分子激光机，瑞士达芬奇飞秒激光，日本进口眼底荧光血管造影机、眼底激光仪，波前相差仪，非接触眼压计，角膜地形图仪，澳大利亚进口全自动视野机，德国进口蔡司光学相干眼底扫描仪（OCT），韩国进口自动电脑验光仪，西班牙进口角膜曲率测量仪及国产眼A/B超，小泪道激光治疗机，同视机，弱视治疗仪，综合验光仪等大型仪器。