泌尿外科成立于1998年，是杭州市中医院较年轻的科室，但发展迅速，拥有专科门诊、病区、实验室等。现开放床位36张，医师9名，其中主任医师1名，副主任医师5名，主治医师2名，住院医师1名。博士1名，硕士5名。

科室拥有全市最先进的体外碎石机、尿流率分析仪、钬激光治疗仪、输尿管镜、电切镜、膀胱镜等仪器设备。

泌尿外科能开展膀胱镜下肾、输尿管、前列腺等常规手术20余种，其中前列腺ca根治、全膀胱切除、肾、输尿管膀胱肿瘤等治疗已经普及，输尿管镜下碎石、膀胱肿瘤电切、前列腺增生电切等泌尿科各类手术几乎每位医师都能熟练掌握。

泌尿外科拥有国外引进先进的体外碎石机，能在门诊进行体外碎石，有效率和成功率都在杭州市处于领先地位。泌尿外科研制了一系列的中药特色制剂应用于临床，治疗排石、男性不育、性功能障碍灯，有较好的疗效。