眼科是医院的重点扶植科室，是一个建制完备的临床一线科室，设备先进、技术实力雄厚，拥有18位高级职称的专家，配备眼底病，白内障，泪器病，屈光视光，角膜病，青光眼等各临床眼科亚专业。开展针对眼前节疾病、眼后段疾病以及外眼疾病等多种现代眼科显微手术，对眼科疾病诊治具有丰富的经验，并担负着全省防盲指导、国家“视中”省级培训基地的重任以及科研、教学和临床医生规范化培训任务。
眼科现有医护人员40余人，其中医生28人。有博士学位7人，其中博士后2位。硕士学位10人。硕士研究生导师3人。主任医师4人，副主任医师14人，主治医师8人，住院医师2人。技术力量雄厚，拥有各方面专业人才。
眼科除了为广大眼疾患者提供一流优质医疗服务以外，非常重视科研工作，重视新技术新项目的开展。眼科是浙江省医学会防盲分会的主委单位，是浙江省医学会眼科分会的副主委单位，也是浙江省防盲指导中心和浙江省眼病研究所所在地，在我省眼科的学术推广以及防盲治盲技术的推广方面起着重要的作用。
主要治疗各种角膜病、白内障、青光眼、视网膜脱离、葡萄膜炎、眼眶骨折和眼眶肿瘤、斜弱视、屈光不正，以及泪道疾病等所有眼科范围的各类疾病。
先进高效的设备，团结奋进的队伍，保证了眼科中心多项治疗技术领跑于省内。
眼科配备有包括博士伦、爱尔康、蔡司、海德堡、歌德等国际知名眼科手术设备及相关眼部检查仪器，近年来引进国际先进的广角成像眼底血管造影系统、高分辨率光学相干断层扫描仪，白内障玻切手术一体机以及高清广角手术成像设备，第V代Polydiagnost泪道内窥镜系统及STORZ鼻内窥镜系统、飞秒激光仪等设备，在全省眼科处于领先地位。
眼底病专科能够很好开展几乎所有的玻璃体视网膜手术、治疗，在国内较早开展视网膜-脉络膜同步造影以及PDT治疗黄斑CNV，省内最先开展广角镜下复杂性玻璃体视网膜手术，其中广角镜下微创技术的掌握处于省内领先行列。对于各种复杂特殊类型视网膜脱离、各种复杂眼外伤、严重增殖性糖尿病性视网膜病变、黄斑裂孔、黄斑前膜以及其他各类眼底疑难病症都有非常好的治疗效果。吊顶灯辅助广角镜下的23G、25G的玻璃体视网膜手术是眼底病专科的特色治疗。2015年首创的三项手术术式：玻切联合重水辅助巩膜外放液治疗严重出血性视网膜脱离、气体灌注下玻切取样提高玻璃体疾病检测率、生长因子孵育联合内界膜移植治疗黄斑裂孔，居国内领先水平。
白内障专科在省内较早开展了1.8毫米微切口超声乳化技术，使白内障手术往更微创方向发展，跻身于省内先进专科行列。在积累了大量白内障手术经验的基础上，开展了超声乳化术治疗各种复杂性白内障，为患者提供单焦及多焦人工晶体植入选择，更好地解决不同人群的个性化需求，尤其多焦人工晶体的植入，为患者提供了满意的看远看近均舒适的术后视力效果。
眼科屈光中心已有二十余年的历史，在杭州市最早引进开展近视屈光手术。中心拥有美国航空航天局太空总署批准的第五代Intralase飞秒激光设备，联合美国威视VISXS4IR准分子激光系统的虹膜定位、个性化切削技术，能让无数近视眼患者即刻摘镜，恢复时间更短、恢复效果更佳、视觉质量更高。在弱视治疗方面，近年来开展脑视力形觉训练项目，用于小儿以及一些成人弱视的治疗，取得了很好的效果。
泪器病专科拥有世界上最先进的德国第V代泪道内窥镜系统及鼻内窥镜系统等设备，开展泪道逆行置管术、人工泪管植入术、泪道内窥镜微创治疗，内镜下的鼻腔泪囊吻合术，鼻泪道置管术，泪器肿瘤切除术，泪小管断裂吻合术及流泪相关的整形手术，提高了一次手术成功率和五年再通率，治愈率达98%。
青光眼专科开展了各期各型青光眼的个体化治疗，并推广我院优势的植入引流阀治疗难治性青光眼技术，使过去大部分需摘眼球的患者保住了眼球，提高了生活质量。
眼科中心对眼眶骨折、眼眶肿瘤等眼病诊疗独具特色，活体角膜移植，屈光晶体植入治疗超高度近视、眼底病激光治疗及光动力治疗等均处于省内领先水平，有些还填补了省内空白。
近3年眼科已成功申报包括国家自然科学基金、国家博士后基金、省科技厅重大专项、省科技厅、省自然基金在内的十余个课题，并在各级学术刊物上发表论文近50篇，其中SCI论文20余篇。获得浙江省各类医药卫生科技奖多项。
努力贯彻以病人为中心，医疗、教学、科研为一体，承担了温州医学院、浙江中医药大学、杭州医学院的教学任务。本科室拥有硕士生导师三名，培养研究生多名。中心同时还担负着全省防盲指导和国家“视中”省级培训基地的重任，也是地市级眼科专业医生的主要培训中心和住院医师规范化培训基地。
