儿科是以儿童血液、肿瘤疾病为专业技术特色的综合性临床科室。同时，承担北京大学医学院预防医学系七年制临床教学、首都医科大学临床医学系五年制临床教学、首都医科大学护理本科教学，以及护校儿科教学、见习和实习。
专业结构：儿科设有门诊、急诊、儿童保健;病区设有床位26张，其中血液肿瘤病区床位20张、普通病区床位6张。
医护人员结构：医生14名，护士24名。职称结构：高级职称5名，中级职称2名，初级职称7名。
学历结构：博士3名，硕士9名，本科2名。专业特色儿童血液、肿瘤专业国内率先开展基于德国化疗方案的儿童中枢神经系统肿瘤的手术+放疗、化疗的序贯治疗
2009年起，在德国儿童神经肿瘤专家、德国儿童脑肿瘤项目(HIT/GPOH)负责人S.Rutkowski教授的指导下，该科在国内率先开展了基于德国化疗方案的儿童中枢神经系统肿瘤的手术+放疗、化疗的序贯治疗，显著提高了我国儿童中枢神经系统肿瘤患儿的生存率，填补了我国在该治疗领域的薄弱环节，受到国内众多神经外科专家的密切关注。目前，已形成北京天坛医院、北京儿童医院，以及广州、上海、武汉、四川等地的脑肿瘤术后患儿在医院儿科接受术后化疗的治疗路径。现已收治儿童恶性脑肿瘤患儿5000余例，开展相关科研项目8项，发表学术论文10余篇。
国内首次全面采用德国儿童血液肿瘤协作组(GPOH)化疗方案施治我国小儿白血病
2000年起，该科在前儿科主任孙黎明教授的带领下，与德国汉堡大学儿童血液、肿瘤中心开展临床治疗合作，在德国汉堡大学儿童肿瘤中心主任Janka-Schaub教授的指导下，在国内率先采用德国儿童血液肿瘤协作组(GPOH)治疗方案，治疗儿童白血病并获得成功。这是国内首次全面采用国际最先进、最有效的化疗方案施治该国小儿白血病的病例，对我国儿童白血病临床治疗是一次重要的创新和贡献。迄今，该院儿科采用GPOH治疗方案治疗儿童血液肿瘤患儿已近二十年，并经过引进、研究和改造，现在，该科已经形成了独具特色、具有国际先进水平的儿童白血病化疗方案。
病房环境/医疗设备该院儿科，从门诊到病房，配置有适宜儿童就医的人性化设施，病区环境安静而温馨，血液、肿瘤病区还配有现代化层流设备的洁净病床。
