性病科为中国医学科学院皮肤病医院（研究所）的临床业务科室之一，也为中国疾病预防控制中心全国性病控制中心的临床基地，示范门诊。建科以来，治疗了数以万计的性传播疾病及生殖器相关皮肤病患者。年平均门诊量为2万人次。现有医师6人，实验室检验技术人员5人，护士1人。其中主任医师1人，副主任医师2人，副主任技师1人。拥有医学博士学位4人，医学硕士学位1人。性病科也为博士研究生培养科室，博士生导师1人。

性病门诊设有性病诊室、阴道镜检查室、性病化验室、健康教育咨询室。性病诊室环境良好，能为就诊者提供一对一的诊疗空间，保护患者隐私。本科擅长诊疗各种性传播疾病、生殖道感染及外生殖器部位常见皮肤病（如包皮龟头炎、鲍温样丘疹病、固定性药疹、阴囊湿疹、女阴湿疹、龟头银屑病、扁平苔藓、萎缩性硬化性苔藓等）。阴道镜检查室有专业的电子阴道镜设备，由接受过专业培训的医生和护士对女性患者进行规范的电子阴道镜检查。性病化验室有先进的检验设备、引进分子诊断新技术、检查项目齐全，开展了针对梅毒、淋病、生殖道沙眼衣原体感染、生殖器疱疹、尖锐湿疣、HIV感染、生殖道支原体感染、女性下生殖道感染等的各种检测项目。为南京市艾滋病检测初筛实验室。率先在国内开展了多项性病病原体的核酸检测工作，包括生殖支原体核酸检测，沙眼衣原体的核酸定量检测，低危型及高危型人类乳头瘤病毒的核酸定量检测，Ⅰ型和Ⅱ型单纯疱疹病毒的核酸检测；有多种血清学检测技术，包括梅毒血清学试验（RPR定量及TPPA），HIV抗体的筛查（ELISA及蛋白印迹试验）及单纯疱疹病毒抗体的分型检测；同时开展了多种病原体的培养，包括淋球菌的培养，解脲脲原体及人型支原体的培养及药物敏感性试验。除此以外，还进行白带常规镜检，白念珠菌抗原，阴道毛滴虫抗原，尿道分泌物涂片及阴虱的镜检，以及梅毒螺旋体暗视野显微镜检查。健康教育咨询室针对各种性病、艾滋病、生殖道感染相关问题为就诊者提供面对面的咨询指导、健康教育。性病科在性病诊疗及男性与女性生殖器相关皮肤病的诊疗方面形成了自身的特色，能为皮肤性病患者提供规范化的诊疗和预防服务，性病诊疗水平在国内领先。

作为医院的科研和防治结合型临床科室。多年来在性病临床、防治、科研等方面开展了大量工作并取得了一定成就。承担过国家自然科学基金、世界卫生组织项目、世界银行贷款项目、卫生部临床学科重点项目，教育部、江苏省卫生厅135重点人才等多项研究课题。与美国马萨诸塞州立大学医学院和Tufts大学建立了科研合作关系。目前参与的在研项目有美国NIH合作项目（1U19AI084048）“实验性和人淋球菌感染的先天性和获得性免疫”；美国NIH资助的与Tufts大学的国际合作项目（1R01AI116969-01A1）“粘膜淋球菌感染的全基因转录组分析”；江苏省临床医学研究中心项目“梅毒的省内诊疗体系建设和转化医学研究”；中国医学科学院医学与健康科技创新工程的协同创新团队项目----重要性传播病原体的分子流行病学及耐药机制研究；同时承担临床药物试验和体外诊断试剂的研究工作，在本科完成临床验证的北京欧蒙生物技术有限公司的梅毒螺旋体抗体IgM检测试剂盒（间接免疫荧光法和免疫印迹法2种试剂盒）于2016年10月获得国家食品药品监督管理局批准获得医疗器械注册证（体外诊断试剂）。目前在研的体外诊断试剂检测工作有优思达生物技术有限公司的沙眼衣原体(CT)核酸检测试剂盒（恒温扩增-试纸条法）和凯普生物公司的生殖道感染常见病原体检测试剂盒（PCR+导流杂交法）。

作为中国疾病预防控制中心性病控制中心的临床基地，性病科的医技人员参与国家性病防治规划和技术指南的制订、实施与评价。组织制订有关技术标准、规范和方案，并督导检查实施；开展对性病规范化服务和实验室技术人员培训工作及技术指导；作为性病规范化示范门诊，接受全国各级医疗机构的性病临床和实验室技术人员的进修学习。举办过多次全国继续医学教育学习班，为全国性病防治工作培养技术人才。