南京大学医学院附属口腔医院（南京市口腔医院）儿童口腔科是国内较早成立的、专治儿童口腔疾病的科室，年门诊量30000余人。科室有10台牙椅，每台牙椅均安装电视屏幕，可随时播放儿童动画片，室外有小型儿童游乐场，深受孩子的喜爱。

科室现有医师9名，其中高级职称4名（主任医师2名，副主任医师2名），硕士研究生4名，其中1人担任国家级专业委员会委员。医务人员具有扎实的专业知识、丰富的临床经验和规范熟练的操作技能。是一支结构合理，业务能力较强的队伍。

开展各项儿童龋病防治（龋病充填，牙体牙髓和根尖周病的治疗），乳牙、多生牙拔除，儿童缺牙间隙保持器的修复以及吮指，异常咬唇等不良习惯，反牙合（俗称“地包天”）的治疗及早期干预。开展“六龄牙”的窝沟封闭术。对于婴幼儿门牙龋病无法修复的采用进口氟化漆制剂涂擦表面，无需钻牙，抑制龋坏，控制发展，维持至换牙。在儿童乳牙外伤及年轻恒牙外伤冠折的活髓保留及儿童外伤牙脱落后的再植处理有独到之处。创新开展笑气（N2O）镇静镇痛补牙技术（俗称无痛补牙）。

科室还承担南京大学医学院口腔医学专业七年制和三年制硕士研究生教学及带教任务。近年来在省级以上口腔专业杂志发表论文约40余篇，SCI文章1篇，获市级优秀论文奖4篇，还获得省市级科技进步奖3项。