病理科从1933年起就已经开始简单的病理检查，于1957年由张道中主任正式建科，现为江苏省医学重点专科。2015年组织病理外检量达7.5万余例，细胞学诊断病例4.3万余例，分子病理1.3万例，免疫组化检测5.6万项，特殊染色近4千例，新生儿尸体解剖140例，外院病理会诊达3千余例。

科室现有医技人员47人，主任医师2人，副主任医师、副教授及副主任技师6人，中级职称12人，初级职称27人；其中博士10人，硕士24人；科室现有硕士研究生导师3人。设有组织病理学、细胞病理学、分子病理学、病理技术室、免疫组化室、生物样本库等部门，占地面积约3500平方米。科室多人曾到美国MDAnderson癌症中心、德国莱比锡圣乔治医院、西澳大学附属KingEdwardMemorialHospitalforWomen和PrincessMargaretHospitalforChildren、日本顺天堂医院和癌研有明医院以及台湾台北荣民总医院和新光吴火狮纪念医院等进修学习。科室自从2002年起至今聘任美国波士顿VA医学中心病理科黄勤博士为病理科名誉主任或顾问，主要负责指导科室的规范化病理服务、年轻医师培训以及科研工作等。

病理科现为国家住院医师规范化培训基地，并承担南京大学医学院、南京医科大学等研究生的教学和培养工作，承担周边医院诊断医师进修和培训。近5年来，病理科获得国家自然科学基金项目资助4项，江苏省“六大人才高峰”项目等4项，市局级重点项目或课题以及卫生青年人才培养项目8项，资助科研基金600余万元。3年来，发表专业学术论文60余篇，著作4部，并参与制订国内多项病理共识和指南。

2015年11月，我科张道中主任和聂进军主任被中华医学会授予“中国病理事业突出贡献专家”称号。