长海医院消化内科成立于1976年。2000年被批准为消化内科专科中心（2006年升级为研究所），2001年被批准为国家重点学科、上海市医学重点学科。2003年被批准为中华医学会消化内镜专科医师培训中心，2006年被批准为亚太消化内镜学会培训中心，2010年被批准为教育部创新团队，2012年被批准为上海市“重中之重”临床医学中心，2013年被批准为国家临床重点专科，是《中华胰腺病杂志》和《JournalofInterventionalGastroenterology》杂志、《医学参考报－消化内镜学频道》报的主办单位。

消化内科在许国铭、李兆申等教授的带领下，历经30余年建设，逐步形成了“消化疾病内镜诊治、胰腺疾病基础与临床研究、胃肠动力障碍疾病诊治、炎症性肠病和早期胃肠道肿瘤微创诊治”为主的五大学科特色。深入开展胆胰疾病内镜微创治疗，国际率先建立四项胰腺癌内镜诊疗新技术，提高了胰腺癌患者的生存率和生存质量，国内率先开展慢性胰腺炎胰管结石体外震波碎石术，国内率先开展重症急性胰腺炎早期脏器功能支持和后期并发症微创治疗新技术，急慢性胰腺炎诊治处于国内领先水平，国内率先开展早期消化道肿瘤内镜微创治疗，国内较早开始炎症性肠病内镜治疗及以生物制剂为代表的药物治疗，建立我国消化内镜质控标准和专业人才培训体系，为我国消化内镜技术普及和快速发展做出重要贡献。

学科规模在“十一五”期间得到进一步发展，目前学科共有三个病区共133张床位，先后成立了胰腺重症监护病房、消化内镜诊疗中心（总面积3600m2）、消化系疾病基础研究实验室。年门诊量20万例次，住院收治7000例次，年完成内镜诊治例数超过8万例次，其中内镜逆行胰胆造影（ERCP）、超声内镜（EUS）及胰管结石体外震波碎石术（ESWL）达8000例次。近年来，学科相继承担了国家教育部创新团队项目、国家重大新药创制专项、国家十一五科技支撑计划、国家自然科学基金重大国际合作项目等一系列重大课题。共发表SCI收录论文224篇，主编《现代胰腺病学》和《上消化道内镜学》等专著30余部。学科先后获得国家科技进步二等奖5项、国家教学成果二等奖1项、上海市科技进步一等奖4项、上海医学科技一等奖。学科成员先后担任国务院学位委员会学科评议组成员、中华医学会常务理事、中华消化内镜学会主任委员、常委兼秘书长、中华消化病学会副主任委员和常委等重要学术职务。共培养消化内科专业硕士研究生136名、博士生75名、博士后10名，其中2人获“全国百篇优秀博士论文”，为全国培养消化专科及消化内镜专业技术人才2400余名，培养留学生50余名。

消化内科现有主系列人员56名，其中主任医师、教授5名，副主任医师、副教授26名，主治医师、讲师20名，主系列人员平均年龄37.6岁，其中90%获得博士学位，80％有国外学习经历，形成一支梯队合理、朝气蓬勃、积极进取的学科队伍。