心脏大血管外科（心外科）是昆明同仁医院的重点科室之一，病房有床位41张，有独立的心外科ICU和层流手术室。心外科由陈智豫、雷芸、高瞻、李福凝、邓伟等学科专家带队，并聘请原延安医院院长、心胸外科主任陈圣邦教授为顾问，组成具有丰富临床诊疗和护理经验的30人医护团队。同时该院还与国内各大心脏中心（阜外心血管病医院、北京安贞医院、上海儿童医学中心等）有密切合作。

心外科病房配有两人间、三人间和五人间，所有房间均有独立卫生间和洗澡间，能满足不同患者的需求;同时病房还配有床旁监护仪、无创心功能监测仪、GE和飞利浦除颤器、呼叫系统、完整的抢救车等医疗设备。手术室为两间百级净化手术间，配有德国进口STOCKSC型人工心肺机、DRAGERFabius2000和Fabiusplus麻醉机、进口GE监护仪、血液回收机、全套进口手术器械、各种齐备的手术和抢救设备，具备新生儿和婴幼儿以及各种复杂体外循环手术的条件。心胸外科ICU为层流净化独立ICU，有监护病床7张，其中2个隔离病房，配备DRAGEREvita2dura、PB840呼吸机、进口飞利浦GE监护仪、血液透析仪、主动脉内囊反博，先进的设备为危重病患复苏抢救提供了最有利的条件。

在强大的专家团队和先进的医疗硬件支持下，目前该院心血管外科已经开展以下手术：先天性心脏手术、风湿性心脏病瓣膜置换手术、冠脉搭桥术、大血管手术、复杂先心病矫治术、完全性和部分性异位肺静脉引流矫治术、低能重婴幼儿手术、漏斗胸矫治手术、不停跳心脏冠脉搭桥术、心脏移植术、肺动脉瓣狭窄及肺动脉瓣闭锁矫治术、升主动脉全弓替换+象鼻术、Bental’s手术、主动脉根部成形+升主动脉置换+冠状动脉移植、瓣膜置换+射频消融术等手术。