神经疾病中心是重庆医科大学附属第三医院重点打造的集医疗、教学、科研为一体的临床医学中心，是重庆医科大学硕士学位授权点。科室采用中心制医疗模式，即神经内科与神经外科相整合，全面、系统的开展各种神经疾病的综合治疗。现中心共计医务人员75名，其中高级职称5名，中级职称11名，初级职称59名；其中硕士生导师5名。目前设立床位约188张，年诊治住院患者达2500例以上，包括：A、B、C、D四个病区，设有：神经电生理室、神经心理评估室、神经重症病区、脑血管疾病专病门诊、垂体腺瘤专病门诊、帕金森专病门诊、癫痫专病门诊、头晕及头痛专病门诊、睡眠障碍专病门诊、神经内科及神经外科专家门诊和普通门诊。科室还承担国家科技攻关“973”项目分题，国家“十一五”，“十二五”科技支撑项目分题，重庆市重点自然基金等项目。获得医疗成果、科技成果奖15项。在国外权威杂志发表权威论著30余篇，国内外核心核心期刊发表100余篇论文，主、参编专著37部。
诊疗范围1、脑(脊髓)血管疾病：急性脑梗死（包括超早期的静脉溶栓治疗、脑血管造影术及血管内介入治疗）、颅内动脉瘤夹闭术和介入栓塞术、脑动静脉畸形切除术及介入栓塞术、高血压脑出血、蛛网膜下腔出血、短暂性脑缺血发作、颅内静脉窦血栓形成以及脑缺血性头晕、头痛等治疗。
2、神经系统肿瘤:垂体瘤、星形胶质细胞瘤、胶质母细胞瘤、生殖细胞肿瘤、颅内各部位脑膜瘤、颅咽管瘤、听神经瘤、脊索瘤、髓母细胞瘤、室管膜瘤、脑干肿瘤、脊髓胶质瘤、神经纤维瘤、血管网织细胞瘤等，尤其对于颅内深部肿瘤、巨大肿瘤等高难度、高风险手术有丰富的临床经验，临床效果好。同时还开展肿瘤切除术后化疗、伽马刀等综合治疗。
3、颅脑及脊髓创伤：治疗各种类型的颅脑和脊髓创伤有丰富临床的经验，尤其是对于特重型颅脑创伤、全身多脏器复合伤的救治，包括重型颅脑创伤的亚低温治疗、有创颅内压监测、呼吸机生命支持、去骨瓣减压手术、颅内血肿清除术以及脑创伤恢复期的系统康复治疗等。
4、中枢神经系统感染：在内外科相结合的中心制的基础上，科室不仅可对病毒性脑炎、化脓性脑膜炎、结核性脑膜炎、新型隐球菌脑膜炎、神经梅毒、脑寄生虫病（脑囊虫病、脑肺吸虫病、脑型血吸虫病等）等常见中枢神经系统感染性疾病进行诊治，还可以行脑脓肿微创穿刺引流、脑脓肿切除术等外科治疗。
5、脊柱脊髓病变：急性脊髓炎、脊髓空洞症、脊髓亚急性联合变性、脊髓血管病（包括缺血性和出血性脊髓血管病、硬脊膜动静脉瘘、髓内动静脉畸形）、小脑扁桃体下疝畸形（Chiari畸形）、骶管囊肿、脊柱或脊髓占位、脊柱裂等。
6、神经功能性疾病：开展三叉神经痛、面肌痉挛微血管减压、难治性帕金森病进行脑深部电刺激术治疗（DBS）、难治性癫痫（包括：癫痫病灶切除术、迷走神经刺激术-VNS）等手术治疗等。
7、睡眠障碍：开设睡眠障碍专病门诊，针对失眠症、发作性睡病（白天过度嗜睡症、猝倒发作、睡眠瘫痪、睡眠幻觉）、阻塞性睡眠呼吸暂停综合征、不安腿综合征等进行诊治。
8、神经系统变性疾病和运动障碍性疾病：运动神经元病（肌萎缩侧索硬化、进性性肌萎缩、进行性延髓麻痹、原发性侧索硬化）、阿尔茨海默病、额颞叶痴呆、血管性痴呆、帕金森病、小舞蹈病、肝豆状核变性、特发性震颤等。
9、神经-肌肉接头和肌肉疾病：重症肌无力、周围性瘫痪（低钾型周期性瘫痪、高钾型周期性瘫痪、正常钾型周期性瘫痪）、多发性肌炎、皮肌炎、进行性肌营养不良、线粒体肌病、线粒体脑肌病等的治疗。
10、神经心理疾病：科室开设有神经心理专病门诊，针对焦虑、抑郁、躁狂等神经心理疾病进行诊治。
11、立体定向神经外科：颅内肿瘤、癫痫、帕金森病等的伽马刀治疗，颅内不明性质病变的立体定向活检手术以及其他神经调控技术等。
仪器设备科室设备齐全、功能先进，拥有国际一流的神经影像学检查设备：GEoptimaCT660128排螺旋CT、GEBrivoMR3551.5T磁共振、GEInovo大平板DSA(数字剪影全脑血管造影仪)、国际上最先进的Leica0H6神经外科手术显微镜、美敦力开颅动力系统、DORO头架、DORO脑牵开器、蛇牌显微神经外科手术器械、德国Drager和美国泰科（BP840）呼吸机、经颅彩色多普勒（TCD）、SOPHYSA的颅内压监护仪、24小时脑电监测系统、美国最新尼高数字化脑电图仪NicoletEEGV32以及一台数字化肌电图仪Natusneurology、心理测试软件系统及完善的康复设备。
