风湿免疫科主要从事风湿病的临床诊治工作，开设有专家门诊、专科门诊、专病门诊，病房暂设在北院区。现有医师10人，其中高级职称3人，医学博士2人，医学硕士8名。

科室坚持合理检查、合理诊断、合理治疗。诊治病种包括系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、干燥综合征、系统性硬化症、炎性肌病、脊柱关节炎、血管炎、自身免疫性肝病、痛风、骨关节炎以及不明原因的发热等多种疾病。目前常规开展抗核抗体、抗中性粒细胞胞浆抗体、自身免疫性肝病抗体谱、抗CCP抗体、抗心磷脂抗体谱、HLA-B27基因检测、角膜荧光染色、滤纸试验、唇粘膜活检、关节超声等专科检测项目。在采用免疫抑制剂、生物靶向药物、血浆置换等方式个体化治疗多种常见风湿病及危重病例方面有较丰富的临床经验。

近年来，科室先后发表SCI及中华系列杂志等论文30余篇，承担江南大学医学院、南京中医药大学、南通大学等医学院校的见习、实习及进修医师、规培医师的带教工作。