苏州大学附属儿童医院新生儿是江苏省重点临床专科和重点临床学科，儿科硕士、博士授予点。科室设床位150张，其中NICU床位50张，学科现设有新生儿呼吸、消化、神经、感染、心血管等亚专科。具备NICU必需的专业设备如万级层流病房、常频/高频/CPAP呼吸机、高级暖箱、床边彩超、脑功能监护仪等。专科医师31人，其中主任医师5名、副主任医师6名，博士生导师1名、硕士生导师6名；担任省级以上专业学会主任委员3人，委员多人。

专科常年开展各种临床诊疗技术如呼吸机治疗、换血疗法、表面活性物质治疗、一氧化氮吸入、肠外营养术、外科手术等，在解决疑难危重疾病方面技术突出。主要技术优势包括：重症新生儿监护、新生儿脑损伤的临床防治、新生儿肺损伤的临床防治、极低出生体重儿管理、危重新生儿转运系统，新生儿外科开展新生儿普外、胸外、脑外等手术。