药剂科是我院的重要部门，承担着医疗、教学、科研及药事管理等多方面的工作。在医院各届领导的重视和正确领导下，药剂科经过几代人的不懈努力，各项工作得到全面发展，有力地支持和保证了医院其他学科医教研工作的顺利开展。
成都军区总医院药剂科现有门诊西药房，住院药房，中心摆药室，普通制剂室，中药制剂室，药学情报及资料室，高干病区药房，药库及实验室，共8个班组。
全科共有技术人员60人，正副主任药师8人，主管药师14人，中级职称以上人员占药师的50%以上，药学技术人员占员工的90%以上。其中硕士学位6人，在读博士2人，博士2人，药学本科以上人员29人，占29%;大专以上人员占69%;3年后预计本科以上人员将达到40%，大专以上人员将达到80%。
良好的硬件是保证药品质量和开展医院药学工作的重要条件，药库、药学情报室、实验室、国家药物临床试验机构等设施分布于我院新建的综合大楼内，逐渐引入药品管理的微机化系统，实现药品库房管理的微机化。并将进一步通过多套系统的相互连接，实现信息资源的共享，保证药品入库、出库、记价等工作准确无误。为保证药品质量，保障患者用药安全，药库严格按照GSP管理，在原药库的基础上建立了开放式的微电脑自动控制冷库（2°C—8°C）和增加阴凉库（10°C—20°C）面积，进一步确保生物制品制剂的质量。这一系列硬件设施的投入，都为我院药学工作的科学化发展奠定基础。制剂楼设有普通制剂、中药制剂、输液库房、制剂研发中心和制剂成品库房等，2008年经改造，制剂生产环境符合GPP要求，拥有配套的医院制剂生产设备，新建实验室拥有3台HPLC、1台GC、3台紫外分光光度仪、1台荧光分光光度仪、1台HPCE、1台美国雅培AxSym血药浓度分析仪等多种先进的分析测试仪器设备，为开展TDM、临床药学、药物质量控制和药学科研等工作提供了有力的保障。
建立健全了药剂科的各种规章制度和标准操作规程。采取各种干预措施提高服务质量，加强药品管理，为病人提供安全、及时的服务。重视科室文化建设和职工的专业与人文素质教育。
门诊西药房包含有门诊药房、夜间药房、自费药房，日平均调剂处方3000余张。住院药房为1500余张床位的住院患者提供药品保障。各药房在完成繁重的医疗任务的同时，注重提高服务质量、文明服务、礼仪对人，改善服务态度，创建患者满意窗口。
制剂室形成了具有配制制剂范围广、剂型多样、质量稳定的特色，在医院的医疗、教学和科研工作中发挥了重要的作用。我院具有一批深受医生和患者欢迎并且是临床不可缺少的品牌制剂，扶正益胃口服液、复方生化颗粒、感冒颗粒、肾衰康颗粒、萎胃宁颗粒、胃病康颗粒、辛苍颗粒等制剂均为目前生产的优秀品种，产生可观的经济效益和社会效益。
临床药学科具有与国际接轨，以临床药物治疗为主的新的人才结构与工作模式，22位中高级药师经过临床医学知识与技能培训，8位药师主要从事临床药物治疗工作，药学人员参与临床合理用药监督、评价、指导以及药物不良反应监测，单独设立用药咨询室，提供用药咨询服务。并承担了四川大学华西药学院《临床药物治疗学》的教学任务。拥有美国雅培AxSym血药浓度分析仪、HP1200,1100型高效液相色谱仪等先进的分析仪器和设备，能够开展环孢霉素、茶碱、庆大霉素、地高辛、吗啡、抗癫痫药、抗凝药等药物的血药浓度分析和临床个体化用药方案设计。2005年2月被认定为国家卫生部临床药师培训基地，认定专业有消化、抗感染、呼吸、肿瘤、心血管。积极开展临床药学工作，多年来连续举办国家级继续医学教育项目临床药学新进展学习班，承担多届卫生部临床药师培训工作，结业学员数量多、水平高，遍布全国各地，是全国临床药师培训试点模范基地，得到卫生部领导的高度评价。
结合临床药学服务进行科研，主要的研究方向为临床药学、临床药理学和医院药剂学。目前已在遗传药理、群体药动学、循证药学、体内药物分析、中药新剂型等方面培养了队伍，开展了具有先进水平的工作。药剂科近几年公开发表了百余篇论文。药剂科的研究论文多次在全国或北京地区药学学术年会获奖。
药剂科历年来对教学工作都十分重视，在教学实践中，药剂科教师不断总结创新，建立了具有药学教育特点的教学方法，积累了许多宝贵经验，也取得了一定成绩，多年来承担了四川大学、成都医学院、成都大学大批药学专科生、本科生、研究生和进修生的教学和实习工作。与第三军医大学联合招收硕士生。
国家药物临床试验机构I期临床试验研究室设在本院药剂科，实验室能够承接化学药物、生物技术药物和天然药物等各种I期临床研究和生物等效性研究。目前已承接并完成了数十项研究项目，包括科技部“863”项目支持的临床研究以及一类新药I期研究
