香港大学深圳医院急诊科于2013年5月15日正式投入服务，并于2013年10月23日开展24小时急诊服务。香港大学深圳医院急诊科部门主管为刘飞龙医生。在刘飞龙医生的带领下，所有香港大学深圳医院急诊科的医生和护士都根据香港标准进行培训，并定期参与海外培训和参观学习。香港大学深圳医院急诊科将沿用香港急诊分流制度，根据临床需要评定患者的优先级别。香港大学深圳医院急诊科将竭力为病人提供最优质的急诊服务。

香港大学深圳医院急诊科提供24小时急诊服务，地点位于医院门诊医技楼负一层。