小儿遗传代谢内分泌科建立于上世纪80年代，专业创始人是向承发教授。2017年医院正式设立小儿遗传代谢内分泌科，是四川省最早成立以及最大的儿童内分泌遗传代谢诊治中心之一。

科室现有教授、副教授3人，主治医师3人，住院医师3人，其中博士5名，硕士3名，主管护师1名，专科护士6名。病房拥有开放床位26张，年出院病人约4000人次，年专科门诊量约3万人次。科室注重人才培养，技术力量雄厚。科室骨干人员先后赴美国费城儿童医院、麻省大学医学院、辛辛那提儿童医院、上海复旦儿科医院、武汉同济医院等国内外著名研究机构和儿童医院深造学习，与国内外多家医疗机构保持密切学术交流。

开展小儿内分泌各种激发检查、糖尿病3C治疗等特殊的内分泌操作和诊疗技术，医院检验科和产前诊断中心为遗传代谢罕见病诊治提供强大技术支持，诊治病种几乎涵盖所有儿童内分泌遗传代谢疾病，在矮小症、性早熟、肥胖、糖尿病、甲状腺疾病、肾上腺疾病、性发育及性分化异常、尿崩症、骨代谢异常、有机酸血症等内分泌及遗传代谢疾病诊断和治疗随访方面，取得丰富临床经验。