重庆医科大学附属第二医院中医科正式成立于1971年10月，目前有全国名老中医、中西医结合专家1名，副教授、副主任医师2名，主治医师3名，中级针灸技师1名，住院医师（均具有硕士学历）3名，开设床位20张。科室门诊常年不休，每周1至周5全天开设中西医结合专家门诊1个，副教授门诊2个，针灸理疗室1个；周6、周日开放副教授门诊1个.

科室以中西医结合为特色，对临床常见内科疾病，采用中医中药结合西药加以治疗，疗效明显。特别是在睡眠障碍、心血管疾病、脾胃肝胆疾病、呼吸系统疾病的治疗方面，具有相当的特色和优势。对失眠、瘙痒、便秘、慢性咽炎及一些疑难杂病，通过中西医结合治疗，常可以收到意想不到的效果。

科室有电针治疗仪、中药熏蒸床、中药熏蒸椅、电脑中频脉冲治疗仪、电脑三维牵引床、电子生物反馈治疗仪等治疗仪器，针灸理疗治疗室优势突出，不仅对面瘫、脑血管意外后遗症、骨质疏松、骨质增生、失眠等慢性病有显著的疗效，而且对带状疱疹、痛经、盆腔炎等急性发作的疾病也具有很好的疗效，深受患者好评。