重庆医科大学附属第二医院康复医学科始建于上世纪90年代初，经过十余年的发展，目前是重庆市医学重点建设学科，重庆市“十一五”重点学科，重庆市工伤保险定点康复机构，重庆市住院医师规范化培训基地，重庆市高校唯一康复医学博士学位授权点和留学生培养基地，重庆医科大学康复治疗技术本科专业主办单位。已培养数十多名博士、硕士研究生和国外留学生。重医附二院康复医学科在全国均拥有重要的学术地位和学术影响力，是集临床、教学、科研综合实力于一体，有康复门诊、治疗室面积超过2000平方，病房80张床，拥有先进设备仪器和雄厚技术力量的团体。目前科室拥有种类齐全的先进康复理疗设备，其中非手术脊柱减压（颈椎）系统为国内首台，设备总值达到1000万元。近年来，学科主持国家自然基金科研项目2项、重庆市卫生局重点项目2项、面上项目2项；近年来发表CSCD(SCI)科研论文60余篇。

1．在中风偏瘫康复、脑外伤康复、脊髓损伤康复、周围神经损伤康复治疗方面居领先水平在西部率先探索开展自体骨髓间充质干细胞注射结合康复训练治疗脊髓损伤的临床研究，为上述患者的进一步康复提供了新途径。率先开展的卒中单元中风患者康复评定与中西医结合康复治疗，效果明显，康复的早期介入已使大量中风患者最大程度恢复了身心功能，康复技术属于先进水平。

2．肌骨超声及超声的临床研究水平先进研究逐渐由基础向临床应用方面过度。获得厅局级课题2项，国家自然科学基金项目1项。

3．骨科康复与疼痛康复全国首先开展非手术脊柱减压系统治疗颈椎疾病和腰椎疾病，明显提升了治疗效果，在全国处于领先水平。学科突破传统方法的局限，开展了近年来国内外先进的系列无创或者微创治疗技术,比如：冲击波治疗肩周炎、腱鞘炎、骨不连、股骨缺血等；大型脉冲磁场治疗骨质疏松症。