生殖中心诞生于1999年，为省内不孕不育专业诊治龙头单位。曾诞生国内首例自然周期的体外受精-胚胎移植技术助孕成功妊娠的生殖中心。目前开设不孕不育女科门诊、复发性流产、反复种植失败多学科协作门诊、男性不育门诊、遗传咨询与优生优育门诊及心理咨询门诊等多种特色门诊。2）产前诊断：该亚专科涉及国计民生的重要临床科室，亚专科特色包括：1.产前诊断、优生遗传咨询、胎儿医学门诊；2.羊膜腔穿刺术，脐静脉穿刺术；3.胎儿医学多学科联合会诊等。另外我科配有安徽省分子医学重点实验室，各亚专业主攻方向稳定、人才结构合理、技术特色鲜明。主持承担多项国家级、省级、部级等临床紧密结合基础的科研项目，多次获得安徽省科技进步二、三等奖，已经发表SCI文章80余篇；拥有博士生导师6名、培养博士5名，硕士近200名。