安徽省立医院眼科是安徽省特色专科，硕士学位授予点、眼科专科医师培训基地。目前学科有四个病区，包括总院、南区、康复部、微创医学中心各一个病区，共有正式床位99张。专科人员57人，其中医师21人。护士30人，技术员6人，医师队伍中硕士以上学历者占65%。2012年住院患者约4500例，住院手术4300余台次，年门诊量约80000人次。此外还按照政府要求，每年组织贫困地区免费白内障手术医疗队行白内障手术3000余例。

科室现有眼底病、白内障、综合眼病等专业组，学科带头人及各专业组骨干技术水平较高，人才队伍结构合理，形成技术团队，处理疑难重症能力强。年均开展新技术及新项目3项，年均发表论文20余篇，目前在研省级课题5项。2006年“玻璃体切割术治疗复杂糖尿病视网膜病”获安徽省科技进步三等奖，2012年“安徽省人口致盲原因流行病学调查及其防治对策研究”获安徽省科技进步三等奖。

省医眼科担负了全省及邻省地区眼科患者的诊治工作，依托自身的技术和设备优势进行大量的眼科复杂疑难疾病的诊治，临床诊疗技术位于省内领先、国内一流水平。