四川省医学科学院·四川省人民医院病理科成立于1951年，老一辈医学专家吴德诚从美国带回一批病理学书籍，开始创建病理诊断，当时由检验科制作切片，内科指导医师吴德诚主任兼做诊断。1956年老一辈病理学家李懿堂开始创建病理室，1982年改病理室为病理科。病理科同时是电子科技大学临床医学院病理教研室、四川省病理专科医师培训基地、病理硕士点。现已发展成为非常重要临床病理学科，担负着医院的临床病理诊断、尸体解剖诊断、科研和教学任务以及院外会诊工作。

病理科目前共有38位工作人员，16名医师。主任医师2名、副主任医师1名、副主任技师1名，中级职称10余名，博士2名，硕士10名。现任科主任为徐钢主任医师。

病理科设置较齐全，包括拥有四个标准取材台的外检取材室、常规病理制片实验室、冰冻切片室、组织化学实验室、免疫组织化学实验室、分子病理实验室、细胞学实验室、尸体解剖室及病理资料档案室等。拥有冰冻切片机2台、全自动组织脱水机4台、自动包埋机3台、石蜡切片机8台、全自动染片机3台、全自动免疫组化染色机4台，还拥有原位杂交仪、PCR仪、凝胶成像仪、实时定量PCR仪、荧光显微镜、五人及十人共览多头显微镜等设备，还有数码图象采集及分析系统和图文报告系统等。建立了组织化学、免疫组织化学、分子病理实验及诊断、尸体解剖、法医解剖及法医诊断等临床病理平台。开展检查项目包括活体组织检查、手术大标本的组织病理检查、穿刺细胞学、液基细胞学及常规细胞学检查、术中冰冻切片检查，免疫组化诊断、分子病理诊断及法医诊断。临床组织病理诊断病例每年达5万余例，细胞学诊断达10余万例，特别是对骨关节肿瘤、乳腺肿瘤、皮肤病及肿瘤、淋巴造血系统肿瘤、细胞学病理诊断和法医病理诊断具有优势，承担四川省大量的疑难病例的病理会诊。病理诊断水平居四川省内先进水平。每年接收进修生、实习生、规培生数十人，为四川省基层医院和兄弟医院培养了大量的病理诊断医师及病理技师。多次获得省卫生厅科技进步奖多项。