南京总医院心胸外科创建于1948年,第一任科主任为留美专家吴公良教授是中国第一代心胸外科创始人之一,现李德闽任科主任,申翼、胡小南为科副主任。

东部战区总医院心胸外科是江苏省“135工程”重点学科，南京军区心血管病研究所外科部。博士后、博士、硕士研究生培养单位。重症心脏瓣膜置换、冠状动脉搭桥手术、大血管疾病综合治疗、复杂先天性心脏病矫治、胸外科手术(食管、肺、纵膈等疾病）、机器人和胸腔镜微创外科、危重急症病人救治在军内外享有盛誉。