消化内科于2014年12月单独分科，现已成为南康地区规模最大、水平最高、设备最全、最先进的消化内科。科室拥有优秀的医护队伍,有医师15人，护士18人；高级职称4人，硕士3人。现包括一个内镜中心，开放病床共45张。
科室能熟练诊治消化内科各种常见疾病，对胃十二指肠溃疡、炎症性肠病、肝硬化腹水、食道胃底静脉曲张破裂出血、急性胰腺炎、胆总管结石等疾病的诊治具有丰富的临床经验，并承担了全区消化内科危急重病的诊断、及抢救工作。
内镜中心可开展常规胃肠镜及十二指肠镜检查、非镇静经鼻胃镜检查、胶囊内镜检查、NBI、FICE等电子染色胃肠镜检查、内镜下食道胃底静脉套扎术及硬化剂治疗、曲张静脉组织胶注射止血术、胃肠镜消化道息肉电凝电切术、消化道狭窄内镜下探条扩张与球囊扩张术、食管癌内镜下普通支架与放疗支架置入术、内镜下消化道异物取出术、消化道粘膜切除术、超声内镜检查、无痛胃肠镜检查、经皮肝穿刺组织活检术、内镜下胃肠道粘膜下肿物剥离术、内镜下空肠营养置入术等。
