上海儿童医学中心检验科于1998年建院时正式成立，致力于全国儿童临床实验医学标准与规范化建设，以及为全院患儿提供高效、准确、及时和经济的检验服务，为临床提供检验咨询服务。同时，密切配合全院医疗、教学和科研等方面工作，是医学院、校的实习基地。检验科目前面积为1402.6平方米，设有生化、免疫、微生物、血液、临检、输血和分子生物学七大专业，开展项目达460余项（含特殊项目），各类设备先进，均为国际国内的主流品牌，实验室管理与检测技术日趋标准化、信息化、自动化和微量化。2010年通过中国合格评定国家认可委员会实验室认可；2018年获得上海市医学检验质量奖；2019年获得上海市卫生健康系统“最美服务窗口”；2020年获得上海市抗击新冠肺炎疫情先进集体；2020年获得上海市医师协会检验医师分会“抗疫检验特别贡献团队”；2021年获得上海市卫生健康系统三八红旗集体。

现有员工62人，其中高级职称7名、中级14名；博士7名、硕士6名；博导2名、硕导1名。有10余名人员曾赴美国、荷兰、香港等地进修学习，参加国内外重要的学术交流，将先进管理理念和前沿技术带回医院，有力推进了科室的发展。科室科研团队主要研究方向：遗传性疾病，肿瘤基因诊断、发病机制及靶向药物研发研究。近5年，获得国家自然科学基金项目9项，省部级项目11项，市、局级项目4项，和院校级项目7项，各类项目资助总额达1610万元。发表第一或通讯作者SCI论文39篇，总IF：166.65，最高IF：15.302，IF>5分论文6篇；中文核心期刊20篇。9人获得“浦江人才”、“市科委优秀学术带头人计划”“新百人计划”和“优青”等市局级或医学院人才计划。11人受聘国内主流学术组织的主任委员或委员、2人担任著名杂志编委。科室人员荣获上海细菌耐药监测网“优秀个人”称号，中华医学会临床输血学分会“突出人才”称号，上海市医师协会检验医师分会优秀检验技师，上海市医学会检验医学分会和中国疾病预防控制中心寄生虫预防控制所“青年寄生虫技能竞赛”优胜奖，上海交通大学“三八红旗手”荣誉称号，上海儿童医学中心“院长奖-个人奖”、“创全文明岗”、“党员示范岗”等个人奖项30余人次。