第二炮兵总医院中医科是集医疗、科研、教学、保健、文化于一体的综合性中医科室。该科室以弘扬祖国传统医学和文化为宗旨，以“姓军为兵，无愧百姓”的院训为指导，以精湛的医术和全方位的服务为特点，就诊范围涉及中医内科、外科、妇科、男科、皮肤科、儿科等多个专业。几十年来，在几代学科带头人的带领下，中医科不断攻克顽疾，早在七十年代，该科张会川主任率先应用益气活血法治疗脑血管疾病，在该领域取得了全国领先地位，造福了一方百姓。九十年代，带领该科医护人员针对干燥综合征、肺间质纤维化、红斑狼疮等疾病研制了“燥症1号”、“抗纤汤”等制剂。郭志红主任擅用经方，提倡扶阳法治疗疑难杂症，在病患中有良好口碑。张蓉主任秉承传统医学理念，结合现代医学知识诊治疾病，很好地继承和发扬了祖国传统医学，在亚健康、冠心病、糖尿病、高脂血症、膝骨性关节炎、过敏性鼻炎、慢性咳喘等领域有一定心得，所研制的中药“抗疲劳颗粒”曾在汶川地震抗震救灾的广大官兵中应用，提高了战士们的体力，极大地鼓舞了士气。

中医科通过全科医务人员的集体努力，发挥了中医药的特色，建立起了一支有专长、有层次、有特色的医疗队伍。医疗技术水平和服务质量有了新的进步和提高，先后被评为“医院先进科室”、“全军中医药先进科室”等。科室以临床工作为中心，并以科研促进临床工作，“十五”期间获全军医疗成果三等奖九项，参与国家自然基金一项。