科室拥有名誉科室主任一名，为全国著名消化内科及消化内镜专家郭学刚教授，主任医师2人，副主任医师4人，主治医师6人，住院医师4人。其中博士2人，硕士5人。另外医院介入治疗组还有3名消化疾病介入治疗医师，人才配备较为合理。科室拥有最先进的消化疾病检查治疗设备，能满足临床诊疗需求，全科医疗设备总值近2000万元。
消化内科门诊：在门诊综合楼四楼拥有三间消化疾病专科诊室，每天均有3名高年资主治医师或副主任医师以上的专家出诊，确保门诊医疗工作质量，每年的门诊量在50000人次左右。
消化内科病房：在住院部10楼，拥有高级套间病房，单人病房、普通病房等52张病床。病房环境良好，能满足不用层次患者的临床需求。科室实行严格的三级检诊制度，确保及时诊断各有效治疗，消化内科是医院的优质护理单元，确保护理质量安全可靠，每年住院2500人次左右，深受住院患者的好评。
消化内镜中心：在门诊楼五楼，拥有7间内镜检查治疗室，一间ERCP治疗室，胃镜、肠镜、小肠镜、十二指肠镜、胶囊内镜、超细内镜、超声内镜、、治疗内镜、高清内镜、放大内镜、注水泵、CO2发生器，完善配套的内镜清洁消毒设备，洗肠仪，碳呼吸检测仪，爱尔博氩气刀，多功能全数字X射线装置。每年胃肠镜检查治疗约20000人次左右。
消化内镜中心实行无间断内镜：常规开展消化内镜检查，急诊随时查。无假日内镜：所有的节假日正常开展消化内镜检查。无痛苦检查：开展无痛内镜，超细胃镜，胶囊内镜。零等待报告：内镜报告稍等片刻即可。零预约肠镜：用结肠灌洗，肠镜检查随到随洗随查。特色医疗：对反流性食管炎、慢性胃炎、消化性溃疡、功能性消化不良、消化道出血、急慢性腹痛、急慢性腹泻、顽固性便秘、溃疡性结肠炎、克罗恩病、肠结核、急慢性胆囊炎、胆石症、急慢性肝炎、急慢性胰腺炎、肝硬化顽固性腹水、肝脓肿、肝囊肿、肝血管瘤、酒精肝病、药物性肝病的治疗积累丰富经验。擅长食管癌、胃癌、大肠癌、肝癌、胰腺癌的早期诊断，对晚期消化道肿瘤的非手术治疗，在福建省最先开展消化道肿瘤内镜下化疗粒子局部注射治疗。消化内科在内镜下治疗、CT及超声引导下治疗、DSA引导下的介入治疗有丰富经验。
消化内镜中心：全面掌握胆胰疾病的十二指肠镜治疗（ERCP）、内镜黏膜下层剥离术（ESD）、超声内镜（EUS）当今消化内镜三大顶尖技术，使消化内镜的诊疗技术进入福建省先进水平。开展无痛胃镜、无痛肠镜、超细内镜、胶囊内镜等检查，避免常规内镜检查的痛苦。急诊消化道出血的内镜下药物喷洒、局部注射、局部结扎、金属钛夹止血治疗，提高危重病人抢救的成功率。在福建省内最先开展幽门狭窄的气囊扩张治疗，对贲门失弛缓、食管癌狭窄、食管吻合口狭窄、食管气管瘘、纵膈瘘、结肠癌狭窄的内镜下探条扩张治疗、气囊扩张治疗、支架治疗有深入研究。开展了消化道息肉、消化道结石、消化道癌前病变、早期消化道肿瘤的内镜下切除治疗。开展了十二指肠镜下胆总管结石取石术、肝门部、胆管、胰头癌所致梗阻性黄疸的胆管支架治疗。
教学科研：学科带头人任厦门大学教授、硕导，兼任南昌大学、安徽医科大学教授、硕导，还担任厦门大学附属成功医院诊断学教研室主任。科室承担厦门大学本科生内科学及诊断学大课授课任务，招收消化内科硕士研究生，接受消化内科及消化内镜的进修生。科室已在国内外期刊上发表论文100多篇，三次获得省部级医疗成果奖，一次获厦门市科学技术奖，研究成果处福建省同类科室先进水平。科室现主持三项军区级、市厅级的研究课题，研究方向消化道恶性肿瘤的早期诊断，大肠癌及癌前病变的基因对比分析，消化道恶性肿瘤的基因药物局部注射治疗，进展顺利，取得预期的研究效果。
对外交流同第四军医大学附属南京医院，南方医科大学（原第一军医大学）附属南方医院，第二军医大学附属东方肝胆外科医院，复旦大学附属中山医院，南京军区南京总医院，南京军区福州总医院建立了良好的合作关系。
