科室组建于1980年，现编制床位40张，医务人员23人。拥有一支临床能力突出、科研力量雄厚的医疗及科研队伍，医师系列中博士、硕士学位的高学历人才占80%以上，有主任医师3名，副主任医师4名，硕士研究生导师4名。拥有总资产为2千多万元的先进消化内窥镜检查及治疗设备。
即将引进智能胶囊内镜、新型超声内镜、新型氩气刀等最新设备并开展相关检查和治疗技术。
科室主要收治病种：消化系统恶性肿瘤、小肠疾病、胆胰疾病、慢性肝病、肝硬化、炎症性肠病、消化性溃疡、反流性食道炎以及一些临床少见的内科疑难疾病。
小肠疾病的诊断及治疗：由于冗长的解剖学特点，深部小肠一直是医学检查的盲区，小肠疾病也一直是误诊率和漏诊率最高的疾病。多年来科室在小肠疾病诊断及治疗方面积累了丰富的经验。我们应用双气囊小肠镜或单气囊小肠镜的检查及治疗技术，对小肠进行直视下检查及治疗，显著提高了小肠出血性疾病、小肠良恶性肿瘤、小肠狭窄、小肠克罗恩病及其他小肠疾病的诊断率。我们在国内最早开展了小肠多发息肉的镜下微创摘除治疗技术。目前已经完成上千例次小肠息肉摘除治疗术：包括对黑斑-胃肠息肉病（Peutz-Jeghers综合症）小肠多发息肉及其他小肠息肉的摘除治疗，小肠出血的镜下止血治疗等，大大提高了临床治愈效果，同时有效避免了开腹手术对患者造成的创伤。
消化系统恶性肿瘤的早期诊断及内科综合治疗：科室每年完成胃镜及结肠镜检查8000余例，在早期胃癌、早期食管癌及早期大肠癌的镜下诊断方面积累了丰富经验，每年检出的早期消化道恶性肿瘤患者，都得到即时治疗。科室自组建至今一直致力于消化道恶性肿瘤的内科综合治疗研究，提倡肿瘤的个体化和中西医结合综合治疗，在肿瘤内科综合治疗方面积累了丰富的经验，大大提高了肿瘤病人的治疗缓解率和生活质量，取得了明显成效，形成了科室的主要临床特色。
消化内镜微创治疗技术：科室的内镜微创治疗技术精湛，开展的治疗技术项目多。主要包括：十二指肠镜下乳头括约肌切开胆管取石术、胆管狭窄的扩张治疗及胆管支架放置术，食道、胃底曲张静脉套扎、硬化等治疗术，消化道急性出血的内镜治疗术，消化道息肉内镜下切除术，内镜下黏膜切除术，消化道狭窄的支架置入治疗术，上消化道异物的内镜治疗，对消化道巨大息肉的镜下治疗具有独到经验。常规开展无痛内镜诊疗术。在国内较早开展双气囊小肠镜的诊疗工作，对大部分小肠疾病进行了有效诊断和治疗。
拥有一支年富力强、具有创新开拓精神的学术科研队伍，其中硕士研究生导师5名，医学博士6名、硕士2名，在读硕士研究生5名。
目前在研课题10余项，获经费资助100余万元。“十五”以来共获各类奖项2项，主编及参编出版专著6部，在统计源期刊共发表学术论文39篇,科室现为中国医科大学、安徽医科大学、大连医科大学、北方医学院硕士研究生联合培养点，有硕士研究生导师5名，现有在读硕士研究生5名。科室为中国医科大学、安徽医科大学等医学院校临床实习基地，北京市专科和亚专科医师培训基地，年平均带教实习生100余人，培训轮转生、进修生40余人。
