眼科为该院重点发展科室，现有医护人员18人，其中高级职称2人，中级职称12人，硕士研究生2人，开放床位16张。多名眼科医生曾到北京同仁医院眼科、天津眼科医院、郑州大学一附院眼科、施尔明眼科医院、省立医院眼科进修学习。国家卫计委白内障复明手术重点扶持科室，山东省防盲治盲定点科室。山东省眼视光与眼镜协会会员单位。国际角膜塑性镜IAOA会员单位。
科室拥有德国ZEISS手术显微镜、德国KeratographD干眼仪、美国爱尔康Laureate超声乳化、美国Optovue光学相干断层扫描（OCT）、美国IRIS眼底激光治疗仪、日本Canon眼底血管造影机、日本NIDEK角膜内皮镜、日本NIDEKYAG激光，眼科光学生物测量仪(IOLMasster)等多台世界顶尖领先设备。尚有综合验光仪、电脑验光仪、非接触眼压计、眼科A/B超等国内最先进设备。
眼科重点开展的手术和治疗项目有：白内障超声乳化术+人工晶体植入术、小切口囊外摘除术+人工晶体植入术、小梁切除术、青光眼白内障联合术、干细胞移植术、鼻内窥镜下泪小管断裂吻合术及泪囊鼻腔吻合术、眼整形术，糖尿病视网膜病变、高血压视网膜病变和眼底出血的治疗，干眼综合治疗、缺血性视神经病变、视神经萎缩等治疗。
