肥城中医院内科由内一科、内二科、内三科、内四科组成。

内一（心血管方向）科室以中西医结合治疗心血管系统疾病为主，系山东省中医药重点专科建设项目，承担山东省中医药科学技术研究项目一项。科室人员梯队配备合理，技术力量雄厚。现有床位47张，并设有重症监护病房。在治疗高血压、冠心病、心绞痛、心肌梗塞、高脂血症、心肌炎、心肌病、风心病、肺心病、肺栓塞、大动脉炎、静脉栓塞、心律失常、难治性心力衰竭、慢性咽炎、过敏性鼻炎、变应性咳嗽、过敏性哮喘、急慢性支气管炎、肺炎、肺气肿、肺心病、心衰、肺纤维化及慢性胃炎、睡眠呼吸暂停综合症等方面积累了丰富的临床经验。

内二是泰安市重点中医专科，系脑血管病专业。科室始终坚持“中西医结合、特色强科”的办科宗旨，不断提高诊断水平和临床疗效。在治疗脑梗塞、脑出血、蛛网膜下腔出血、短暂性脑缺血发作、椎基底动脉供血不足、脑炎、癫痫、头痛等疾病方面积累了丰富经验。开展了脑梗死的超早期溶栓、脑出血微创治疗等技术，大大地提高了中风救治的成功率。采取祖国传统医药和现代医学结合的方法，对脑血管病患者进行系统规范的康复治疗和指导，使脑血管病的预后大为改善，有效减少了脑中风死亡率及后遗症，提高了患者的生活质量。研制开发了平肝通络汤、益气活血汤、岐黄通络饮、中康胶囊、抗栓胶囊等自制制剂，应用于脑血管病的各种证型及不同阶段，取得了满意的临床效果。

内四设有呼吸、内分泌、风湿免疫专业。科室配有电子纤维支气管镜、胰岛素泵、心电图机、呼吸机、无创呼吸机、多参数监护仪等多台先进医疗设备。科室充分发挥中医特色，走中西医结合之路，创特色疗法，尤其对支气管哮喘、慢性支气管炎、慢性阻塞性肺疾病、肺炎、气胸、支气管扩张、各种甲状腺疾病、糖尿病及其各种慢性并发症（如糖尿病肾病、糖尿病性心脏病、糖尿病并脑血管病、糖尿病眼病、糖尿病周围神经病变等）、各种肾病、尿路结石、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、痛风等的治疗有独到之处。