呼吸内科学组成立于2003年，2009年前合并在内二科，2009年5月独立为呼吸内科。本科为医院重点扶持学科，设有呼吸内科病房、维支气管镜室、肺功能室，并设呼吸专科门诊。现有医生、护士20余名，其中主任医师2名，副主任医师1名，主治医师2名，其中硕士2位。现有床位41张。年出院病人1500余人次；年门诊量2万余人次。
呼吸内科广泛开展对呼吸系统各种疾病，如肺部感染、急慢性支气管炎、慢性阻塞型肺病、肺心病、支气管哮喘、肺结核、肺部肿瘤、肺血栓栓塞症、肺间质性疾病等临床常见病、多发病及疑难危重病人的诊断、治疗和科研工作；熟练开展对呼吸系统危重急症的无创通气治疗。
学术地位目前是玉环县最早成立，人员配置较为完善，技术力量最为雄厚的独立的呼吸学科。
技术优势本科室具有独立的专科及专家门诊及肺功能室、纤维支气管镜室。本科室吸内科广泛开展对呼吸系统各种疾病，如肺部感染、急慢性支气管炎、慢性阻塞型肺病、肺心病、支气管哮喘、肺结核、肺部肿瘤、肺血栓栓塞症、肺间质性疾病等临床常见病、多发病及疑难危重病人的诊断、治疗和科研工作；熟练开展对呼吸系统危重急症的无创通气治疗。纤支镜室于2003年在玉环县内首先开展纤维支气管镜的诊疗技术，现熟练开展纤支镜检查、活检、刷检、支气管肺泡灌洗、注药等诊治。肺功能室拥有德国耶格公司最先进的专业肺功能测定系统，。熟练开展各种肺功能检查（包括支气管舒张试验等），能早期诊断各种通气功能障碍和弥散障碍疾病，如肺气肿、肺间质纤维化、哮喘等。
研究方向肺部感染疾病的诊断及鉴别诊断；肺癌的早期诊断及治疗；支气管哮喘及慢性阻塞性肺病的标准化治疗；弥漫性肺间质性的诊治；胸膜腔疾病的诊治。
本科特色配置了Olympus纤维支气管镜检查及摄像系统，积极开展支气管镜检查技术；配置了德国耶格公司最先进的专业肺功能测定系统积极开展肺功能测定，对慢性咳嗽的病因诊断及支气管哮喘及慢性阻塞性肺病的分级有决定性意义。
教育培训本科室人员中有两位曾到浙江大学附属第一医院呼吸内科进修，每年均有选派人员去参加全国及省市呼吸年会，每年选派人员参加呼吸系统疾病的学习培训班。每年参与安徽医大、江西中医学院、台州学院的学生带教工作。
