山西煤炭医院肝胆胰外科是山西省唯一的以肝、胆、胰疾病为主要治疗与研究方向的，实现门诊、住院、手术一体化服务的专业科室，也是该院的重点特色科室，设有独立的层流手术室。该科室技术力量雄厚，现有主任医师2名、副主任医师2名、主治医师2名、医师2名，山西省著名普外科专家王殿臣主任医师为该科室学科带头人。肝胆胰外科装备有目前世界顶级大型医疗设备，如:日本奥林巴斯电子腹腔镜(目前山西省唯一的电子腹腔镜)、日本奥林巴斯腹腔镜用超声刀和等离子电刀、日本奥林巴斯纤维胆道镜、美国惠普多参数监护仪多台。病房设有中心监护台。肝胆胰外科开展腹腔镜微创手术达省内领先、国内先进水平。已开展的腹腔镜手术种类有:胆囊切除术、胆总管探察取石术、肝囊肿手术。同时能开展的传统开腹手术有：肝三叶切除术、胆管癌手术、胰十二指肠联合切除术、胃癌根治术、结肠癌根治术、直肠癌根治术、乳癌改良根治术、甲状腺癌根治术、门静脉高压断分流术等高难度手术。还将开展内镜下胃肠、甲状腺及肝切除手术等腹腔镜手术。