儿童血液科成立于2012年元月，建科之时，省立医院儿科即将儿童血液专业组的人员、技术团队全部转到该院，在总院儿科的全力支持下，在科室负责人李春、刘洪军的带领下，科室逐步发展壮大。

科室现有正主任医师3名，副主任医师4名，主治医师、住院医生、专业护师数名。是安徽省新农合重大疾病（急性白血病、急性再障、血友病甲、乙、慢性粒细胞白血病）定点单位、安徽省儿科学会血液学组组长单位、参与重大疾病和临床路径（急性淋巴细胞白血病和急性早幼粒细胞白血病）的制定和推广。对疑难、危重病人有成熟的经验和较高抢救水平。省内率先开展儿童ALLMICM分型，进行分层诊断和精细治疗，较早开展了儿童出血性疾病和溶血性疾病的诊断和治疗，省内最早能检测凝血因子。

小儿血液与肿瘤治疗是该科特色专业，亚专科方向为移植组、白血病组、实体瘤组和出血性疾病组，主要为小儿贫血、儿童白血病、淋巴瘤、难治性贫血、朗格罕组织细胞增生症、再生障碍性贫血、急慢性、难治性血小板减少性紫癜、血友病、溶血性贫血、肝脾淋巴结肿大、中性粒细胞减少、EB病毒感染、各种出血性疾病等进行诊治。在急性再生障碍性贫血治疗方面，有多例ATG为主联合免疫抑制治疗的成功经验。在综合预防髓外白血病，减少化疗并发症，监测白血病相关预后因素，左旋门冬酰胺酶脱敏治疗ALL，联合免疫抑制治疗重型再障，合理诊治重症感染，侵袭性真菌病早期诊治，有效诊治血友病，改善生存质量等方面与国内、国际先进技术接轨。开展了多种类型造血干细胞移植治疗儿童急性淋巴细胞白血病、急性髓细胞白血病、重型再生障碍性贫血和恶性淋巴瘤等，整体移植水平已跻身国内先进行列。