绍兴二院血液科为绍兴市血重点学科，诊疗技术处于绍兴市领先水平。目前有主任医师1名，副主任医师2名，主治医师3名，住院医师1名，其中硕士研究生3名。科室目前床位40张，层流室4间，层流床1张，血细胞分离仪2台。科室主要诊疗方向为各类血液系统疾病：如淋巴瘤、多发性骨髓瘤、各类白血病、贫血、骨髓增生性疾病、血小板减少、血栓和各类复杂出凝血性疾病。1999年以来已开展了异基因骨髓及自体干细胞移植术，血细胞分离、血浆置换等诊疗技术。目前与浙一血液科开展合作，浙一专家每周行专家查房和专家门诊各一次，进一步提高了二院血液科的整体技术水平。