2009年医院二级分科后成立了呼吸内科，2014年初，医院扩建病房，增设呼吸内科病房，十六病区应运而生。近年来在医院的大力支持下，在福建医科大学附属第二医院呼吸内科的对口支援下，经过全科医护人员的不懈努力，不断开展新技术、新业务，科室已具有一定规模，综合诊治能力已处于全市领先水平。
2.仪器设备：拥有电子支气管系统、肺功能测定仪、多功能呼吸机等先进诊疗设备。
拥有一批高素质、高学历、老中青结合的学术团队。现有医生9名，主任医师1名，副主任医师1名，主治医师2名，住院医师5名，其中硕士研究生3名。
可开展经支气管镜钳取气管、支气管内异物；利用支气管镜行肺泡灌洗治疗危重肺部感染、支气管扩张、手术后肺不张的病人。
2.胸水气胸微创治疗利用中心静脉导管与带针导管经皮穿刺抽水抽气，具有损伤小、操作简便、痛苦轻、引流彻底的特点。
3.慢性难治性咳嗽的诊治引起慢性咳嗽的原因多达100余种，科室已建立起一套较完整的诊疗程序，可为长年累月受慢性咳嗽困扰的患者解除痛苦。
4.重症哮喘的特效治疗联合利用MDI吸入、ICS/LABA干粉吸入及SABA、M-R拮抗剂、ICS持续雾化吸入治疗哮喘，可起到药到病除立竿见影的效果。
5.慢性阻塞性肺病慢性阻塞性肺病的发病率日益增加，科室采用国际金标准精确检测，鉴别发病的原因，判断气道阻塞的部分，评估肺部疾病的严重程度，采用个性化的综合治疗方案，确保临床上的医疗质量。
承担福建医科大学、福建中医药大学、泉州医学高等专科学校、漳州卫生职业学院等高等医学院校的临床教学任务，定期接收基层卫生院、社区卫生服务中心人员进修及乡村医师规范化培训。
