消化科由住院病房、消化门诊、肝病门诊等、内镜中心组成。目前有医护人员40余人。有副主任医师5人，主治医师（主管护师）12人。博士研究生学历1人，硕士研究生学历6人。门诊对腹痛、腹泻、消化不良、幽门螺杆菌感染、慢性肝炎等消化系多发病进行规范化诊治。内镜中心除进行常规胃肠镜检查外，目前大力开展内镜下早癌的筛查，目前以发现较多的食管、胃及大肠早癌，在树兰医疗及省内消化专家的指导下目前已进行早癌内镜黏膜下剥离（ESD),大量开展内镜下息肉切除及消化道梗阻的支架置入术。病房收治消化道出血、腹痛待查、急性胰腺炎、肝硬化等病人。科室大多医生在北京、上海、广州等大型医疗中心进修。目前承担泉州市级科研项目3项。发表论文20余篇。