临床药学室成立于2003年，现有专职临床药师7人，覆盖心血管内科、肾内科、ICU科、消化内科、呼吸内科、儿科、血液肿瘤科、神经内科、肝胆外科。2018年成为首批中华医学会临床药学分会临床药师规范化培训中心。日常参与医学查房、药学查房、医嘱点评、病例讨论、药历书写、药学监护、药师会诊、患者用药教育、药物信息咨询服务、药事管理平台数据上报、抗菌药物监测网数据上报、合理用药培训、药讯编写、抗菌药物动态监测、药物不良反应监测上报、科研等工作，为该院安全合理用药起到了积极的促进作用。
临床试验机构办公室吉林省一汽总医院临床试验机构成立于2008年，现有十二个临床专业分别于2010年11月和2014年6月通过国家食品药品监督管理总局资格认定检查并获准开展临床试验，具体专业为老年病、消化、神经内科、呼吸、肾病、内分泌、肿瘤、妇科、泌尿、骨科、传染、烧伤，以上所有专业于2017年3月通过复核审查，2018年11月完成医疗器械临床试验机构备案，正式成为国家医疗器械临床试验机构，现有内科、外科、妇产、肿瘤、眼科、皮肤、妇产、检验、核磁等31个医疗器械临床试验专业。机构根据《中华人民共和国药品管理法》、《药物临床试验质量管理规范》及《医疗卫生机构开展临床试验研究项目管理法》等相关法律法规，建立了完整的质量保障体系，对各类新药及器械临床试验进行有效管理并保证临床试验过程规范，结果真实、准确、及时、可靠。
