泉州市第一医院眼科是泉州市重要的眼病诊疗专科，集临床、教学、科研于一体，拥有17张床位，承担福建医科大学、宜川医学院、泉州医高专等院校的实习教学。目前拥有医师7人，其中副主任医师3人，医学硕士1人，在职硕士生1人，主治医生3人，验光师2人，多位医师先后到国内同仁眼科医院、中山眼科医院、湖南湘雅二医院等著名眼科医院进修学习，师从国内著名的眼科专家。该科室拥有Leica手术显微镜、Paradigm超声乳化仪、Aps-600型计算机视野计、眼科AB超声仪、Leica眼压计、冷冻器、角膜曲率仪、Keeler间接双目眼底镜、Nidek裂隙灯等先进眼科仪器设备。该科目前开展的眼科诊疗项目有：白内障超声乳化术、视网膜脱离手术、角膜移植手术、抗青光眼手术、眼部整型手术、斜视手术、眼眶肿瘤手术、泪器手术、眼外伤手术及屈光不正的验光配镜、RGP的验配。该科有多篇论文发表在眼科杂志上，目前完成的课题有《卡托普利抑制小鼠氧诱导视网膜病变模型新生血管的形成》。