安徽省儿童医院临床检验科自1989年成立以来，科室规模不断壮大，现有工作人员50人，其中博士2人，硕士研究生7人，本科学历37人；副主任技师2人，主管检验师22人，检验师16人，其中执业医师2人，检验医师1人。

检验科设有门急诊检验室、临床生化检验室、临床微生物检验室、临床免疫检验室、临床分子诊断室、流式细胞室、血液病实验室、儿童艾滋病筛查实验室、儿童微量元素检验室等。为安徽省儿童医院及全省儿科疾病研究提供了科研平台。

目前开展的特色检测项目，如药物浓度分析（VPA、MTX）、药物相关性基因、人类白细胞B抗原基因检测，避免用药造成严重并发症；呼吸道病原抗体检测；食入及吸入物过敏原IgE抗体检测；食物不耐受IgG抗体检测；末梢血CRP及SAA测定；耳聋易感基因检测，对于遗传性耳聋的诊治提供更精准的依据；白血病相关融合基因的检测，明确突变基因同时结合染色体核型分析，准确地将新发白血病定型；儿童生长激素测定，对于矮小症的诊治具有重要的临床意义;遗传代谢血、尿筛查，辅助诊断遗传代谢性疾病。

作为教学医院承担安徽医科大学、蚌埠医学院、安徽医专、巢湖职业技术学院、阜阳职业技术学院等医学院校检验专业本、专科学生的实习带教工作，每年接收20人左右。近年来，临床检验科主持完成省厅级科研课题2项；科研课题《安徽地区肠道病毒EV71基因分型与儿童机体免疫功能关系的研究》2014年被原安徽省卫生计划生育委员会批准立项（课题编号：14FR017）；作为主要完成人，完成安徽省自然科学基金课题1项。曾获安徽省省级科研成果1项，厅级科技进步一等奖1次，2017年获得国家自然科学基金项目1项。