临床营养科成立于2014年，并于2015年开设营养门诊，临床营养科营养会诊已普及至全院所有科室。

作为安徽省省内唯一一家专业的临床营养科室，临床营养科是中华医学会安徽省肠外肠内营养分会儿科学组、中华医学会安徽省儿科分会临床营养学组组长单位。2018年被评为“十三五”院级重点培育专科。

临床营养科擅长新生儿、早产儿静脉营养和喂养；肿瘤（白血病）化疗（移植）后，外科手术、危重症患儿的住院期间营养支持治疗和出院后营养支持；牛奶蛋白过敏的规范诊断和治疗；肥胖、营养不良（挑食厌食）；发育迟缓、糖尿病、肾脏病等多种临床疾病的营养治疗及膳食指导、食谱制作。通过营养支持治疗，促进疾病恢复，降低各种术后并发症发生率，提高多种危重疾病（如腹部重大手术、肠瘘、胰腺炎等）的治愈率，缩短住院天数，降低医疗费用，加强肿瘤病人对化疗、放疗等治疗的耐受性，提高了病人的生存率和生存质量。对儿科特殊消化道疾病，如短肠综合症、肠瘘等慢性肠功能衰竭伴重度营养不良患儿的诊治和营养治疗方面具有丰富经验。

临床营养科拥有人体成分分析仪等仪器，可对患儿，尤其是肥胖、消瘦等特殊人群的身体状况进行科学分析。同时配备“营养之星”膳食软件，可进行营养风险筛查、膳食调查及饮食和运动管理，为患儿提供更科学、更智能、更有效的膳食指导。

为提高新生儿疾病诊疗水平，提升母乳喂养安全性，该院已加入中国关心下一代工作委员会儿童发展研究中心的中国母乳库推广合作项目，并成立省内唯一一家母乳库。拥有母乳成分分析仪、电动吸奶器、医用超低温冰箱等仪器设备，可根据母乳成分对乳母进行膳食指导，并对母乳进行规范化的采集与储存管理。接收并储存捐献母乳，用于早产儿等高危患儿的营养支持，改善高危儿的临床预后与远期结局，降低喂养不耐受的发生。此外，临床营养科多次开展义诊、营养讲座等宣教活动。

临床营养科现有医务人员3人。其中，副主任医师1人，博士1人，硕士1人。