中医内科门诊始建立于50年代末，是该院最早建立的门诊科室之一，嘉兴市重点建设专科。目前共有20位医务人员，其中正、副主任医师占50%，省级名中医2人、市级名中医4人。

该科医师中医理论功底扎实，并具有相当的现代医学诊疗水平，擅长用中医中药治疗各种中医内科疾病及疑难杂症，亦常用中西医结合方法提高疗效。同时，每年还带教大量中医院校学生、进修医师。

除开设普通中医内科门诊外，还设有中医内分泌、脾胃病、肿瘤、呼吸、肾病、风湿病等多个专科门诊。

运用中医技术优势，在流感的预防上采用香囊、药茶、中药调理多种手段；

针对哮喘、慢性阻塞性肺疾病等慢性呼吸道疾病，运用冬病夏治、膏方、中药汤剂调理综合治疗；在慢性萎缩性胃炎、结肠炎、慢性肝病的治疗上采用中西医结合治疗，效果较好；运用中医辅助治疗肿瘤，提高了肿瘤患者的生存时间与生活质量；中西医结合治疗类风湿关节炎、干燥综合征、痛风等风湿病，能较快缓解症状，减少单纯西药治疗的副作用。