汕头大学医学院第二附属医院微创外科是医院的重点学科，是一个在崭新微创理念指导下的临床跨学科项目，是实践一切为了病人的微创诊疗的国际新医疗模式。中心的宗旨是“以患者为中心，以循证为依据，以微创为手段，为患者提供痛苦小、恢复快的高质量服务”。微创外科包括微创诊疗中心、微创高级病房、学术与培训中心，多学科共同参与、互相协作、资源共享，实现专业特长与优势技术互补，是顺应国际医学发展新趋势，按最先进水平建设的一个极具特色的微创品牌项目。
目前，微创外科拥有国际先进的KarlStorz腹腔镜一体化手术室、全高清电子内窥镜、超声内镜、胶囊内镜、能量平台、超声吸引刀(CUSA)、超声刀、高能超声聚集刀等最新设备，医护人员微创临床经验丰富，已成为粤东地区提供微创技术诊疗的先驱。在陈耿臻教授的带领下，全面开展包括结直肠、上消化道、肝胆、乳腺、甲状腺、疝、血管等专业广泛的微创外科手术，同时开展无痛内镜、ERCP、内镜下肿瘤切除、内镜影像介入诊疗等高级内镜技术和腔镜内镜联合技术，致力为粤东地区病人提供最优质的微创医疗服务。
依托该中心技术力量，汕头大学医学院微创外科研究所在该院成立。研究所旨在促进各学科微创项目的共同发展，推进技术创新，与国内外著名微创医学中心开展合作，举办国内、国际会议，以促进学术交流与发展，并提供微创教育培训和基础研究。
科室团队主持承担国家和省部级科研课题10项、市厅级科研课题11项；在国内外学术期刊发表论文60多篇，其中发表SCI收录论文7篇、核心期刊20余篇；参编医学专著3本，其中陈耿臻教授参编“十二五”普通高等教育本科国家规划教材《外科学（第3版）》；荣获汕头市科技进步奖一等奖一项，汕头市科技进步奖二等奖一项；获国家专利7项，其中《人工肛门直肠假体》获国家发明专利。
