小儿眼科成立于2013年5月。是该院眼科的一个分支学科，主要收治十四岁以下的眼病患儿。科室共有医护人员十六人，其中医生七人，有博士研究生一名，硕士研究生四名，主任医师和副主任医师各一名。分为门诊、住院部和新生儿眼底筛查中心三个板块，并承担了全市近十万名中小学生的体检业务。科室主要业务范围包括少儿验光配镜、斜弱视治疗、眼睑、泪道疾病、眼眶肿瘤及各类先天性眼病的诊治，目前已开展了各类斜视手术、倒睫和上睑下垂等眼睑手术、眼部肿瘤及眼眶手术、眼外伤治疗、泪道探通及各种泪道手术、儿童眼底激光、先天性白内障和青光眼治疗等项目，在湘南地区率先开展了头套式眼底激光光凝术，是郴州市第一家进行假性近视和低度近视治疗的眼科。

目前分设小儿眼科门诊部、住院部和新生儿眼底筛查中心。共同承担小儿眼科学科临床、科研及教学任务。