浙大二院呼吸内科成立于上世纪60年代，是浙江省呼吸疾病科研、教学、诊断与治疗中心之一。是首批国家临床重点专科建设单位，卫生部呼吸专科医师培训基地。浙江省医学重点学科，浙江省重点科技创新团队，医学创新支撑学科，是浙江大学呼吸疾病研究所的牵头单位。现有教授，主任医师6名（其中教育部长江特聘教授1名），副教授、副研究员、副主任医师共12名，主治医师15人。设有专科病房、呼吸重症监护室、睡眠监测室、肺功能室、气管镜检查室和呼吸临床实验研究室。学科的重点研究领域是哮喘和慢性阻塞性肺疾病的分子机制、气道黏液高分泌、慢性气道疾病干预策略、肺部感染、肺癌的分子学研究及个体化治疗、呼吸系统少见罕见疾病的临床和基础研究以及健康教育等方面。近些年来，学科发展迅速，备受业内关注。近年来，学科获国家杰出青年科学基金1项，国家自然科学基金重点项目、国际(地区)合作与交流项目、承担国家十一五支撑项目、973课题、863子课题、国家自然科学基金面上项目和省部级等重大课题二十多项。培养硕士、博士研究生及博士后近百名。2010年获浙江省科技进步一等奖，2012年获教育部科学技术进步奖一等奖，2013年获国家科技进步奖二等奖。2016年或浙江省自然科学奖一等奖。
学科特色专科在哮喘的诊治方面积累了丰富的临床经验，总体水平国内领先，尤其在非典型哮喘如咳嗽变异性哮喘及胸闷变异性哮喘的诊断及治疗方面国内领先，在浙江省内率先开展支气管激发试验诊断哮喘，为国内最早开展此项目的单位之一。对危重症的慢性阻塞性肺疾病急性加重期（AECOPD）治疗上经验丰富。作为主要成员，学科先后完成了我国慢性咳嗽病因分布，舌下含服脱敏治疗哮喘，全国健康人群肺功能正常参考值等全国性大型临床研究项目。不明原因的慢性咳嗽也是呼吸学科的诊治特色之一，根据循证医学的要求，科室已建立起一套完整的诊疗程序，可帮助患者明确病因，解除痛苦。
2.目前已诊治的少见病罕见病以及疑难疾病种类众多，包括肺泡微石症、肺泡蛋白沉着症、支气管淀粉样变、肺-支气管平滑肌腺瘤病、纵隔卵黄囊瘤、肺滑膜肉瘤、原发性肺黏膜相关淋巴瘤、郎罕氏细胞增生症、肺含铁血黄素沉积症、肺组织胞浆菌病等。呼吸内科是省内最早将大容量肺灌洗技术用于肺部疾病诊疗的单位之一。
3.目前呼吸内科已开展了国内绝大多数呼吸介入诊疗操作，总体水平居省内领先，部分项目已达到国内先进水平。已开展的项目有：（1）经支气管淋巴结针吸活检技术（TBNA）；（2）高压球囊扩张治疗良性气道狭窄；(3)电凝圈套治疗良性气道肿瘤；(4)气道支架植入术；(5)内科胸腔镜诊断不明原因的胸腔积液；(6)气道疾病的冷冻治疗及凝固治疗等。
对重症肺炎并发急性呼吸窘迫综合症（ARDS）常规开展床旁气管镜下肺泡灌洗，开展保护性肺通气、床旁持续血液净化（CRRT）技术，显著提高其治疗有效率。所有社区获得性肺炎患者均严格按照临床路径进行规范化治疗，显著缩短其住院时间及费用，取得了良好的治疗效果。国内较早开展CT引导下经皮肺穿刺活检及气管镜下肺活检（TBLB）诊断难治性肺部感染性疾病，使许多少见的肺部感染性疾病（如肺放线菌病、肺奴卡菌病）及非典型的肺结核病得以明确诊断。
与影像学科、病理科等密切合作，开展了B超引导下浅表淋巴结的针吸活检，超声或CT引导下肺部及纵隔肿块的穿刺活检，并配合电子气管镜、内科胸腔镜等，大大提高了肺癌的确诊率。
