眼外伤专科是1980年由陈莲爱、钟国庆、闻祥根等创建的，是国内最早成立的集临床、科研、教学于一体的眼外伤专科之一。现有教授/主任医师3人，副教授/副主任医师4人，主治医师2人，博士研究生导师2人，硕士研究生导师2人。

眼外伤科现有开放床位40张，在眼外伤后复杂性玻璃体视网膜病变、感染性眼病、复杂性虹膜睫状体病变以及严重眼化学伤等眼外伤相关疾病的诊治水平处于国际领先水平，是国内复杂性眼外伤患者的转诊中心；每年培养全国各地进修医生及研究生100多人，是国内眼外伤专科医生培训基地。

眼外伤科是国内眼外伤诊治高新技术研发和应用的主要基地，自行研制开发出眼内型稀土磁棒，解决了眼球内微小异物/眼球后段异物难发现、难取出、手术并发症多等临床难题，该项目于1995年获国家实用新型专利并已在全国得到广泛的推广和应用。目前开展并承担了多项国家及省部级科技攻关项目，包括感染性眼内炎的发病机制的研究，碱性化学伤角膜新生血管的调控的研究，胚胎干细胞在眼化学伤眼表重建的应用的研究，脉络膜新生血管发生机制的研究等。作为牵头科室，眼外伤科参与了“863”计划《可折叠人工玻璃体的临床试用和生产》的多中心临床研究，验证了可折叠人工玻璃体的安全性和有效性，使无法通过硅油/重硅油达到良好视网膜复位的复杂玻璃体视网膜病变患者有了视网膜解剖复位的希望。