深圳市妇幼保健院生殖医学中心位于福强院区，成立于1999年，是全市最早的同类科室之一，2006年获夫精生殖中心（IUI）准入资质，2011年获体外受精-胚胎移植（IVF/ICSI）准入资质。设不孕症门诊（男科和妇科）、B超室、男科实验室、IUI手术室及实验室、病案室、IVF实验室、取卵室及移植室等，配备有B超机、显微操纵系统、解剖显微镜、培养箱、程序化冷冻仪、全自动精浆生化仪等先进仪器设备。全科有博士5人，硕士3人，主任医师5人，副主任医师2人，主任护师1人。科研立项28项，其中国家自然科学基金1项，省级立项课题3项，市级立项课题24项，论文70篇（SCI论文14篇），获深圳市政府科技创新奖１项、ASRM生殖医学手术奖2项、Royan国际生殖医学研究奖1项、院级科研奖项12项。目前开展项目有夫精生殖中心、常规体外受精-胚胎移植（第一代生殖中心）、卵胞浆内单精子注射（第二代生殖中心）、胚胎冷冻保存及复苏、精子冷冻保存及复苏、经皮睾丸穿刺取精术、经皮附睾穿刺取精术等。2013年、2014年临床妊娠率达60%以上，居国内外先进水平。