中西医结合科，现为国家中医药管理局中西医临床重点学科、国家中医药管理局“十一五”老年病重点专科、全国综合性医院中医药工作示范单位;重庆市卫生局中西医结合风湿免疫重点专科、重庆市最早的中西医结合临床硕士学位授权点。下设中医(中西医结合)门诊、中西医结合病房、针灸推拿理疗室、实验室、中药煎药室等部门。本科室由临床经验丰富的中医及中西医结合专家、教授主持门诊、病房诊疗工作。其中教授2人、副教授4人、主治医师8人，重庆市名中医3人。诊疗过程中充分应用中西医取长补短、优势互补的临床诊疗特色，采用药物内外治法及针灸理疗等中医特色疗法，主要诊治内科疾病及其他疑难病症。门诊设立5个中医(中西医结合)诊断室、针灸理疗室，病房设开放床位49张，经过多年发展，已形成具有优势特色的五个重点专业方向：
　　1、风湿免疫病：重点诊治类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、多发性肌炎、硬皮病、干燥综合征等结缔组织疾病;骨质增生、骨质疏松、颈腰椎病等骨关节疾病及各种关节痛、免疫功能异常等。
　　2、老年病与疑难病症：重点诊治各种老年病：冠心病、糖尿病、高血压、慢支炎等;各种瘫痪(包括面神经瘫痪)病症、虚弱性病症、恶性肿瘤手术、放化疗后等。
　　3、消化系统病：重点诊治慢性胃肠炎、消化性溃疡、慢性肝炎、脂肪肝、肝硬化、术后消化不良等消化系疾病。
　　4、肾脏病及血液病：重点诊治肾小球肾炎、肾病综合征、尿路感染(包括前列腺炎)、慢性肾功能衰竭;糖尿病、高血压病、痛风等及继发的肾损害;各种贫血、白细胞减少症、血小板减少、慢性白血病、淋巴瘤等血液系疾病。
　　5、针灸理疗：运用针灸理疗等特色治疗手段，重点诊治面瘫、中风后遗症等各种瘫痪病症，类风湿关节炎、急性扭伤、颈椎病、腰椎病等颈肩腰腿痛各种痛症及头痛、三叉神经痛、末梢神经炎等、顽固性呃逆、便秘、尿潴留、失眠、肥胖等。