微创外科成立于1992年4月，是国内最早开展腹腔镜手术的单位之一。2000年成立独立的微创外科中心。现有在职医务人员17人，其中教授、主任医师1名，副教授、副主任医师1名，主治医师、讲师4人，中青年骨干均具有博士学位。现有床位36张。每年施行各类腹腔镜手术1,300余例，累计施行各类腹腔镜手术12，000余例。
　　微创外科科室特色：在国内率先开展了多次胸、腹腔镜手术治疗，大大拓展了微创技术在临床上的应用范围，率先进行了腹腔镜手术基本原理、腹腔镜新手术的技术原则、腹腔镜手术在治疗恶性肿瘤中的应用等研究。现常规开展的腹腔镜手术有：病态肥胖症的可调节胃束带术、胆囊切除、胃肠道肿瘤切除、胃癌根治、结肠癌根治、脾切除、肝肾囊肿开窗减压、反流性食管炎胃底折叠、疝修补、腹部疑难杂症的腹腔镜探查等，以及胸腔镜下治疗手足多汗症、先天性Q-T时程延长心脏病等。
　　微创外科科室荣誉：长海医院微创外科中心现为国家级重点学科，亚太地区（中国）外科治疗肥胖症中心。学科带头人现为中华医学会外科学分会委员；亚洲内镜外科学会常委；中华医学会内分泌外科学组副组长；全军普外专业委员会微创外科学组组长；亚洲内视镜外科学会常务理事及中国微创外科杂志副主编；中国实用外科杂志、中华胃肠外科杂志、腹腔镜外科杂志等编委；Surgical Endoscopy中国地区唯一编委。