中西医结合肝胆外科是衢州市重点中医专科，以治疗肝胆胰疾病为主，有主任医师3名、副主任医师1名、主治医师1名、住院医师2名，学术梯队合理、技术力量雄厚，经过近20年的发展，该专科已熟练地完成Ⅰ—Ⅳ类肝胆胰手术，拥有成熟的腹腔镜和胆道镜、十二指肠镜技术，熟练掌握腹腔镜下胆囊切除术、肝胆活检术、肝囊肿开窗引流术、胆总管切开取石术、十二指肠穿孔修补术、脾切除术等，完成术中、术后胆道镜检查，治疗逾千例。在肝胆胰系统肿瘤根治性手术、重症胰腺炎的外科治疗、门高压症的手术治疗、中西医结合治疗肝内胆管结石和严重肝损伤的诊治上，积累了大量的病例资料和丰富的临床经验。近年来在十二指肠内镜诊治、操作方面也积累了丰富经验。浙江大学附属邵逸夫医院蔡秀军专家工作站落户该科，其工作团队与该科紧密协作，指导或亲临该院开展肝胆胰方面疑难杂症的诊治。

科室中医特色浓厚，善于应用中医特色疗法，如中药熏蒸、穴位贴敷、针灸等，治疗各种常见肝胆疾病。