内镜中心是近年发展起来的集内镜下检查及内镜下治疗为一体的专业科室。拥有目前国内最先进、最高端的全进口潘太克斯纤支镜及胃肠镜检查系统，具备iscanCE电子染色、电子放大等多种功能，能更清楚、更早期地发现局部微小病变，明显提高呼吸系统和消化道早癌的检出率。拥有奥林巴斯胃肠镜及纤支镜，鼻咽喉镜，拥有技术熟娴、精益求精、服务态度好的内镜诊治团队，为您提供无痛胃镜检查、无痛肠镜检查、食道支架植入、消化道异物取出术、消化道息肉切除术（EMR,APC），电子支气管镜检查；支气管扩张气管镜灌洗治疗术；气管内异物取出术；气管内肿瘤切除术；电子喉镜检查；声带息肉摘除术等内镜下治疗。通过无痛苦、无创伤的碳13、14呼气试验检查能客观、准确地检测患者有无感染幽门螺旋杆菌(简称HP)，并指导进一步治疗。

目前，内镜中心有医护人员5人，副主任医师1人，主治医师2人，护师1人，护士1人，均先后在重庆医科大学附属医院内镜中心，第三军医大学消化科及内镜中心多次进修学习，技术过硬，操作熟练。